Ввиду того, что Япония – страна с преимущественно теплым климатом, здесь очень богатый растительный мир.
Леса покрывают более 67% всей площади страны. В северных широтах леса представлены, в основном, хвойными породами деревьев – ель, сосна, пихта. Южнее произрастают дубы и клены, а также бук.
На острове Хонсю уже часты кипарисы, криптомерия, сосны. На Сикоку и на Кюсю – зубчатый дуб и магнолия японская. Здесь уже царство вечнозеленых субтропических и тропических растений. На островах Рюкю и Окинаве, помимо уже перечисленных вечнозеленых кипарисов и дубов, начинаются пальмы, бамбук, фикусы, различные папоротники. В некоторых местах, особенно на необитаемых островах – встречается японская криптомерия, порой достигающая возраста в 2 тысячи лет. Диаметр такого дерева более 5 метров, а высота – более 45 метров. Горные вершины на острове Хонсю, в том числе и Фудзияма, покрыты альпийскими лугами.
А вот животный мир на Японских островах не так разнообразен, как растительный. Может быть, это обусловлено отдаленностью Японии от основного материка. Однако и здесь вы сможете встретить характерные только для Японии отдельных видов морских млекопитающих, крабов, птиц и рыб. В горах также может встретиться бурый медведь, волки, соболи и лисы, горные антилопы и ласки. На юге водятся японские макаки. В морях и реках много рыбы.